במשך כל השנים, כך מתברר, שפכי ביוב גולמי מהגוררות בנמל אשדוד פשוט נשפכו באין מפריע למי הנמל. מדובר בביוב מהשירותים בו עושים העובדים את צרכיהם, מהמקלחות, מטבח ועוד. השפכים זורמים לים ללא כל סינון או טיפול, כמו שהם היישר למי הנמל.

האמנות בינלאומיות,אגב,  מחייבות לאסוף את הביוב בכלי שיט למיכלים, לשאוב אותו ולהעבירו לטיהור וטיפול במתקן המתאים לכך. על פי המשרד להגנת הסביבה, שפיכת ביוב לים מכלי שייט מותרת על פי אמנת MARPOL בתנאים מסוימים ובמרחק שלא יקטן מ-3 ק"מ מהחוף. לכן,  כלי שייט חייב שיהיה לו מיכל אגירה, אך זה איננו המצב כאן.

פקחי היחידה הארצית להגנה על הסביבה הימית מבצעים ביקורת שוטפת על אוניות הפוקדות את הנמלים המסחריים, ולפני מספר חודשים הוציא המשרד להגנת הסביבה הנחיה לבעלי אוניות ולסוכנים כי חל איסור הזרמת ביוב לים בתחום הנמל (בכך רענן גם הנחייה של רשות הספנות והנמלים).

בעקבות הנחיה זו, עתיד הנמל לצאת למכרז לשאיבת ביוב סניטרי מהגוררות ובהתאם תצא הנחיה להשתמש רק במכלי האגירה בכלי השיט. יש לציין כי המשרד הטיל לאחרונה לא מעט קנסות לאניות בעקבות הזרמת ביוב לים.

אגב, בספינות חיל הים שעוגנות אף הם בבסיס חיל הים באשדוד, אין מיכלי אגירה, אך על פי הנחיות הצבא, חל איסור להשתמש בשירותי הספינות בזמן עגינה. יש להדגיש כי אמנתMARPOL כלל לא חלה על כלים צבאיים אך למרות זאת חיל הים מחיל את כלליה.

מחברת נמל אשדוד נמסר בתגובה:

" חברת נמל אשדוד פועלת במשנה מרץ על מנת להביא לכך שהשפכים מהגוררות הפעילות (2-3 ביום) ישאבו ממיכלי הגוררות אל מיכלית משאית שתפנה אותם לאתר מאושר. חברת נמל אשדוד יצאה למכרז בנושא וכבר הוכרז על זוכה במכרז.

נושא זה מטופל  מול הרשויות המוסמכות: רספ"ן והמשרד לאיכות הסביבה, אשר אישרו ארכה לנמל להסדרת העניין. ללא קבלת ארכה לביצוע מהרשויות, הגוררות היו מושבתות.  בימים הקרובים הקבלן הזוכה יקרא על מנת לקבוע סדרי עבודה בנושא, ותחל שאיבת השפכים מהגוררות הפעילות ופינויים לאתר מורשה".