תחילתה של החקירה החלה בתלונה שהוגשה  במשטרת ירושלים על גנבת ספר תורה עתיק בן יותר מ-100 שנים – בשווי של כחצי מיליון שקלים.

ספר התורה נגנב מאחד מבתי הכנסת של בני העדה הבוכרית בעיר. בתום חקירה, הצליחו השוטרים לאתר חשוד בגנבה, שמתגורר במושב הסמוך לנתיבות.

שוטרי תחנת נתיבות הגיעו אל ביתו של החשוד, אך שם מצאו רק חלק מספר התורה. האיש נעצר לחקירה, ושם סיפר לחוקרים כי מכר את הספר לתושב אשדוד.

החשוד הגיע  יחד עם השוטרים לביתו של תושב אשדוד, לו הוא מכר לטענתו של הספר. משנכנסו השוטרים אל הבית, הם נדהמו לגלות כי הוחבאו בו 27 ספרי תורה, החשודים כגנובים, מאזורים שונים ברחבי הארץ.

רב-פקד יורי מזרובסקי, קצין המבצעים של תחנת נתיבות אמר:

 "החקירה רק בתחילתה, ויש פעולות נוספות שאנו נבצע על מנת לאתר את מקורם של ספרי התורה".

שני החשודים בגניבת ספרי הקודש יובאו בהמשך הערב לדיון בבקשה להארכת מעצרם בבית משפט השלום בבאר שבע.