על פי הידוע עד כה, השפעת החדשה (שפעת החזירים) מידבקת באופן דומה לשפעת העונתית, בעיקר  על  ידי שיעול ועיטוש של אנשים חולים או באמצעות מגע ידיים או מגע בחפץ שעליו הנגיף  ואחר כך נגיעה בפה או באף. אוכלוסיות של גני הילדים ובתי הספר חשופות להידבקות במחלת השפעת (בפרט כאשר הן נמצאות במסגרות סגורות). לפיכך בתי הספר עלולים להיות מוקדים להתפשטות נגיף שפעת החזירים.

בימים אלו נערכים במשרד הבריאות והחינוך לכל תרחיש. המשרדים פרסמו הנחיות מפורטות כלפי צוות מוסדות החינוך וכלפי הורים ותלמידים. בין היתר מבקשים במשרד החינוך לעדכן רשימות טלפוניות למקרה שיידרשו להעביר מידע טלפוני, קיום הסברה בקרב התלמידים, הפצת חומרי מידע למניעת ההדבקות  לבתי התלמידים, הערכות למתן סיוע סוציאלי, נפשי/אחר לעובדים חולים, כמו גם לתלמידים הזקוקים לכך, בשיתוף עם מערך השפ"ח  (השירות הפסיכולוגי- החינוכי).

על פי דרישות משרד הבריאות ומשרד החינוך, מנהל המוסד החינוכי יוציא  הוראה ברורה שלפיה לא יגיעו ילדים או מבוגרים חולים למוסד החינוכי. החזרה ללימודים לאחר מחלה תתאפשר לאחר המצאת אישור רפואי מהרופא המטפל, על פי הכללים המקובלים. במקרה של ילד  חולה על הוריו לדווח למנהל בית הספר כדי שינקוט אמצעים למניעת המחלה ולהתפשטותה. במקרה של ילד שהופיעו אצלו תסמיני המחלה ידאג  בית הספר לדווח להורים ולהפנות  אותם לקבלת טיפול רפואי. ההורים ידווחו לבית הספר  על תוצאות האבחון של הרופא.

מנהל בית הספר  ימנה רכז להתמודדות עם השפעת ולידו צוות המורכב מבעלי תפקידים בבית הספר שיהיו אחראים על הכנתו להתמודדות עם השפעת. הצוות יתכנן את  המשך הפעילות בבית הספר מתוך הנחה לאפשרות של היעדרות מורים בשל תחלואה, וייערך לגיוס מורים בחירום. יש להיערך  להיעדרות של עד 45% מהעובדים למשך 2-1 שבועות בשיא השפעת ולאחוזי היעדרות נמוכים יותר לאחר השיא. במצב של היעדרות מסיבית וחוסר יכולת המוסד החינוכי להמשיך ולתפקד כרגיל, ייערך המוסד החינוכי לשינוי בתכנית העבודה, כגון איחוד כיתות, שינוי תכנית הלימודים ושיבוץ כוח אדם חלופי.

במקרים מסוימים אפשר לשקול סגירה זמנית של המוסד החינוכי תוך התייעצות עם מנהלי המחוז ועם הרופא המחוזי של משרד הבריאות, זאת במקרה של תחלואה משמעותית של אנשי הסגל או תלמידים הפוגעת בתפקוד התקין של בית הספר (יותר מ-45% של תלמידים ומורים) ובבתי ספר מיוחדים, שלומדים בהם  תלמידים בעלי  מחלות רקע בקבוצות הסיכון לסיבוכי השפעת.

היערכות לוגיסטית למניעת הידבקות במוסדות החינוך:

בית הספר יעלה את רמת הניקיון ויקפיד על  הגדלת התדירות של  ביצוע הניקיון בחדרי  השירותים, במטבח, בחדר האוכל ובכיתות הלימוד. יש לנקות באופן שגרתי משטחים  וחפצים שנוגעים בהם באופן תדיר, כגון ידיות, דלתות וברזים. הניקוי ייעשה על ידי  עובדים  העוטים כפפות. בית הספר יכין מלאי של אמצעים מצמצמי הדבקה  (סבונים, חומרי ניקוי,  מגבונים, ממחטות נייר ושקיות ניילון לסילוק פסולת). בית הספר יפרסם הנחיות במקומות בולטים לשמירה על היגיינת הידיים ועל היגיינה   הנשימתית: התעטשות לתוך  ממחטות נייר ושיעול לכיוון המרפק.