על מנת לשמור על רציפות תפקודית לטובת הנוסעים, הרכבות תופעלנה בקווים עיקריים וחיוניים אלה בלבד במתכונת של רכבת מאספת אחת מידי שעה:

* קו נהריה-חיפה-תל אביב-באר שבע (עם עצירות בכל תחנות הביניים המצויינות מטה).
* קו הרצליה-תל אביב-נתב"ג-ירושלים
* קו הרצליה-תל אביב-אשקלון-אופקים (קו טבעת השרון והנגב המערבי).
* קו בנימינה-רחובות/אשקלון.
* קו כרמיאל-חיפה.

בשל מצב החירום בעורף, גיוס עובדים ואנשי אבטחה למאמץ המלחמתי, תנועת הרכבות תופעל בתחנות אלה בלבד:

כרמיאל, נהריה, עכו, קרית מוצקין, מרכזית המפרץ, חיפה מרכז השמונה, חיפה בת גלים, חיפה חוף כרמל (כניסה מזרחית בלבד), בנימינה (כניסה מערבית בלבד),
קיסריה- פרדס חנה (כניסה מערבית בלבד),חדרה מערב, נתניה, בית יהושע (כניסה מערבית בלבד), הרצליה, תל אביב האוניברסיטה, תל אביב סבידור-מרכז, תל אביב השלום (כניסה דרומית בלבד), לוד, קרית גת, ב״ש מרכז, רעננה מערב, כפ״ס נורדאו, ראש העין צפון, פ"ת קרית אריה, נתב״ג, ירושלים יצחק נבון, בת-ים יוספטל, ראשל"צ משה דיין (כניסה צפונית בלבד), חולון וולפסון, יבנה מערב, רחובות, אשדוד עד הלום, אשקלון, שדרות, אופקים, נתיבות.

במהלך היום ובהנחיית משרד התחבורה, מפעילה רכבת ישראל רכבות מיוחדות לפינוי הנוסעים מנתב"ג והן מעמידה לשירותם היסעים לטובת המשך נסיעתם ליעד.

מידע אודות תנועת הרכבות והתחנות הפתוחות לשירות נמצא באתר רכבת ישראל, בישומון, ובמוקד השירות הטלפוני (*5770)